در مجله ترویجی بوم شناسی منابع آبی،  مقالاتی  پذیرفته می‌شوند که علمی- ترویجی بوده و پیشتر در جای دیگری منتشر نشده باشند. هر مقاله حداقل توسط 2 نفر داور متخصص در موضوع مقاله ارزیابی می‌شود. حداقل دو نظر موافق و تأئید هیئت تحریریه مجله برای چاپ مقاله ضروری است. طول مدت داوری (از دریافت مقاله تا پذیرش نهایی آن) به طور متوسط 3 ماه است. پس از انجام داوری، دریافت نامه پذیرش و انتشار مقاله میسر است.